Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SERPINF1P36955 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINF1P36955 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINF1P36955 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINF1P36955 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINF1P36955 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms