Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT20P35900 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT20P35900 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT20P35900 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT20P35900 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT20P35900 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT20P35900 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT20P35900 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT20P35900 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT20P35900 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT20P35900 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT20P35900 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT20P35900 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT20P35900 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT20P35900 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT20P35900 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT20P35900 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT20P35900 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT20P35900 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT20P35900 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT20P35900 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT20P35900 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT20P35900 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT20P35900 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT20P35900 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT20P35900 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT20P35900 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT20P35900 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT20P35900 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT20P35900 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT20P35900 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT20P35900 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT20P35900 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT20P35900 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT20P35900 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT20P35900 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT20P35900 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT20P35900 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT20P35900 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT20P35900 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT20P35900 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT20P35900 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT20P35900 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT20P35900 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT20P35900 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT20P35900 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT20P35900 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT20P35900 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT20P35900 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT20P35900 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT20P35900 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT20P35900 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT20P35900 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT20P35900 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT20P35900 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT20P35900 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT20P35900 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT20P35900 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT20P35900 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT20P35900 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT20P35900 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT20P35900 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT20P35900 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT20P35900 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT20P35900 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT20P35900 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT20P35900 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT20P35900 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT20P35900 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT20P35900 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT20P35900 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT20P35900 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT20P35900 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT20P35900 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT20P35900 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT20P35900 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT20P35900 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT20P35900 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT20P35900 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT20P35900 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT20P35900 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT20P35900 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT20P35900 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT20P35900 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT20P35900 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT20P35900 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT20P35900 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT20P35900 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT20P35900 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT20P35900 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT20P35900 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms