Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB4P30926 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB4P30926 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNB4P30926 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHRNB4P30926 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHRNB4P30926 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB4P30926 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms