Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTAFRP25105 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTAFRP25105 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTAFRP25105 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTAFRP25105 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTAFRP25105 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms