Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP24386 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP24386 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP24386 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP24386 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP24386 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP24386 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP24386 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP24386 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP24386 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP24386 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP24386 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP24386 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP24386 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP24386 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP24386 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP24386 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP24386 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP24386 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP24386 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHMP24386 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHMP24386 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP24386 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHMP24386 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP24386 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP24386 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP24386 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHMP24386 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP24386 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP24386 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP24386 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP24386 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP24386 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP24386 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHMP24386 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP24386 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP24386 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP24386 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP24386 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHMP24386 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHMP24386 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHMP24386 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP24386 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP24386 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP24386 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP24386 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP24386 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP24386 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP24386 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP24386 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP24386 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP24386 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP24386 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP24386 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP24386 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP24386 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP24386 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP24386 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP24386 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP24386 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP24386 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP24386 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP24386 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP24386 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP24386 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP24386 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP24386 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP24386 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP24386 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP24386 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP24386 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP24386 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP24386 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP24386 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP24386 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP24386 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP24386 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP24386 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP24386 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP24386 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP24386 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP24386 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHMP24386 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CHMP24386 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHMP24386 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP24386 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP24386 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP24386 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP24386 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHMP24386 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP24386 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHMP24386 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms