Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB5AP20339 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB5AP20339 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB5AP20339 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB5AP20339 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB5AP20339 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms