Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD53P19397 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD53P19397 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD53P19397 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD53P19397 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD53P19397 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD53P19397 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD53P19397 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD53P19397 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD53P19397 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD53P19397 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD53P19397 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD53P19397 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD53P19397 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD53P19397 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD53P19397 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD53P19397 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CD53P19397 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD53P19397 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD53P19397 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD53P19397 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD53P19397 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD53P19397 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD53P19397 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD53P19397 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD53P19397 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD53P19397 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD53P19397 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD53P19397 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD53P19397 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD53P19397 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD53P19397 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD53P19397 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD53P19397 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD53P19397 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD53P19397 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD53P19397 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD53P19397 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD53P19397 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD53P19397 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD53P19397 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD53P19397 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD53P19397 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD53P19397 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD53P19397 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD53P19397 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD53P19397 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD53P19397 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD53P19397 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD53P19397 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD53P19397 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD53P19397 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD53P19397 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD53P19397 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD53P19397 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD53P19397 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD53P19397 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD53P19397 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD53P19397 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD53P19397 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD53P19397 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD53P19397 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CD53P19397 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD53P19397 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD53P19397 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD53P19397 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD53P19397 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD53P19397 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD53P19397 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD53P19397 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD53P19397 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD53P19397 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD53P19397 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD53P19397 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD53P19397 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD53P19397 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD53P19397 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD53P19397 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD53P19397 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD53P19397 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD53P19397 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD53P19397 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD53P19397 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD53P19397 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD53P19397 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD53P19397 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD53P19397 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD53P19397 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD53P19397 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD53P19397 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD53P19397 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD53P19397 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms