Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKACAP17612 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKACAP17612 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKACAP17612 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACAP17612 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACAP17612 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACAP17612 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms