Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRF1P14222 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRF1P14222 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRF1P14222 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRF1P14222 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRF1P14222 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRF1P14222 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRF1P14222 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRF1P14222 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRF1P14222 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRF1P14222 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRF1P14222 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRF1P14222 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRF1P14222 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRF1P14222 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRF1P14222 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRF1P14222 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRF1P14222 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRF1P14222 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRF1P14222 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRF1P14222 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRF1P14222 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRF1P14222 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRF1P14222 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRF1P14222 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRF1P14222 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRF1P14222 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRF1P14222 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRF1P14222 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRF1P14222 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRF1P14222 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRF1P14222 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRF1P14222 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRF1P14222 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRF1P14222 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRF1P14222 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRF1P14222 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRF1P14222 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRF1P14222 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRF1P14222 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRF1P14222 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRF1P14222 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRF1P14222 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRF1P14222 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRF1P14222 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRF1P14222 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRF1P14222 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRF1P14222 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRF1P14222 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRF1P14222 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRF1P14222 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRF1P14222 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRF1P14222 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRF1P14222 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRF1P14222 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRF1P14222 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRF1P14222 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRF1P14222 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRF1P14222 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRF1P14222 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRF1P14222 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRF1P14222 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRF1P14222 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRF1P14222 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRF1P14222 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRF1P14222 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRF1P14222 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRF1P14222 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRF1P14222 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRF1P14222 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRF1P14222 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRF1P14222 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRF1P14222 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRF1P14222 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRF1P14222 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRF1P14222 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRF1P14222 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRF1P14222 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRF1P14222 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRF1P14222 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRF1P14222 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRF1P14222 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRF1P14222 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRF1P14222 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRF1P14222 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRF1P14222 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRF1P14222 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRF1P14222 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRF1P14222 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRF1P14222 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRF1P14222 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRF1P14222 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRF1P14222 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRF1P14222 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRF1P14222 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRF1P14222 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRF1P14222 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRF1P14222 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRF1P14222 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRF1P14222 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms