Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMIGD3P0DMS9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMIGD3P0DMS9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMIGD3P0DMS9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD3P0DMS9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMIGD3P0DMS9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD3P0DMS9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms