Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC2BP0DI82 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC2BP0DI82 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC2BP0DI82 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC2BP0DI82 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC2BP0DI82 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC2BP0DI82 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms