Protein–RNA interactions for Protein: P0CX38

RPS6B, 40S ribosomal protein S6-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS6BP0CX38 snR78snR78 87 nt9.82□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 HIS2YFR025C 1008 nt9.82□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 FHN1YGR131W 525 nt9.82□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 GID8YMR135C 1368 nt9.82□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 GAL3YDR009W 1563 nt9.81□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 DIG1YPL049C 1359 nt9.81□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 OYE2YHR179W 1203 nt9.81□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 AIM1YAL046C 357 nt9.81□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 ATG17YLR423C 1254 nt9.81□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 MRS6YOR370C 1812 nt9.8□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 YNR029CYNR029C 1290 nt9.8□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.78□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 YPI1YFR003C 468 nt9.78□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 GPN2YOR262W 1044 nt9.78□□□□□ -0.84
RPS6BP0CX38 YHR219WYHR219W 1875 nt9.77□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 DDI1YER143W 1287 nt9.77□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 LSM5YER146W 282 nt9.76□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 ADH1YOL086C 1047 nt9.76□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 YMR209CYMR209C 1374 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 YJL107CYJL107C 1164 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 YKL133CYKL133C 1392 nt9.75□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 TMA23YMR269W 636 nt9.73□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 RSC4YKR008W 1878 nt9.71□□□□□ -0.85
RPS6BP0CX38 YCR099CYCR099C 468 nt9.71□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 NAS6YGR232W 687 nt9.71□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 DLD3YEL071W 1491 nt9.71□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 ERG13YML126C 1476 nt9.71□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 AST1YBL069W 1290 nt9.7□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 SSL2YIL143C 2532 nt9.7□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 SAC7YDR389W 1965 nt9.69□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 YLR046CYLR046C 813 nt9.69□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 YNR068CYNR068C 819 nt9.69□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 ITR2YOL103W 1830 nt9.69□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 THP3YPR045C 1413 nt9.68□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 RSM23YGL129C 1353 nt9.68□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 LSR1LSR1 1175 nt9.68□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 RIB7YBR153W 735 nt9.68□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 KDX1YKL161C 1302 nt9.67□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 ODC1YPL134C 933 nt9.67□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 SNZ1YMR096W 894 nt9.66□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 IMO32YGR031W 1029 nt9.65□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 ENT4YLL038C 744 nt9.65□□□□□ -0.86
RPS6BP0CX38 HOS2YGL194C 1359 nt9.63□□□□□ -0.87
RPS6BP0CX38 URE2YNL229C 1065 nt9.63□□□□□ -0.87
RPS6BP0CX38 DAK2YFL053W 1776 nt9.6□□□□□ -0.87
RPS6BP0CX38 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.6□□□□□ -0.87
RPS6BP0CX38 RRT8YOL048C 1029 nt9.6□□□□□ -0.87
RPS6BP0CX38 MAE1YKL029C 2010 nt9.6□□□□□ -0.87
RPS6BP0CX38 YGL118CYGL118C 438 nt9.58□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 YJL195CYJL195C 702 nt9.58□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 SWP1YMR149W 861 nt9.58□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 DMA2YNL116W 1569 nt9.56□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 YPR126CYPR126C 309 nt9.56□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 CCT5YJR064W 1689 nt9.55□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 RPD3YNL330C 1302 nt9.55□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 ADE8YDR408C 645 nt9.54□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 PIC2YER053C 903 nt9.54□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 YEL074WYEL074W 339 nt9.53□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 ELO1YJL196C 933 nt9.53□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 OPI3YJR073C 621 nt9.53□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 CWP2YKL096W-A 279 nt9.53□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 APM1YPL259C 1428 nt9.53□□□□□ -0.88
RPS6BP0CX38 PSD1YNL169C 1503 nt9.51□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 COX16YJL003W 357 nt9.51□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 YJR114WYJR114W 393 nt9.51□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 VMA11YPL234C 495 nt9.51□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 TIP1YBR067C 633 nt9.51□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 ACO2YJL200C 2370 nt9.51□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 MDM35YKL053C-A 261 nt9.5□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 YMR147WYMR147W 672 nt9.5□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 YNR064CYNR064C 873 nt9.5□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 NAT5YOR253W 531 nt9.5□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 MOD5YOR274W 1287 nt9.5□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 TIM44YIL022W 1296 nt9.49□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 FUN14YAL008W 597 nt9.49□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 YHR218WYHR218W 1812 nt9.49□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 SUV3YPL029W 2214 nt9.48□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 CTI6YPL181W 1521 nt9.48□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 YNL165WYNL165W 1221 nt9.48□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 EEB1YPL095C 1371 nt9.48□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 SFL1YOR140W 2301 nt9.48□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 AI3Q0060 1248 nt9.47□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 YJL211CYJL211C 444 nt9.47□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 YBL081WYBL081W 1107 nt9.47□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 SCO2YBR024W 906 nt9.47□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 SNX3YOR357C 489 nt9.47□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 DPL1YDR294C 1770 nt9.47□□□□□ -0.89
RPS6BP0CX38 ICE2YIL090W 1476 nt9.46□□□□□ -0.9
RPS6BP0CX38 HXT10YFL011W 1641 nt9.45□□□□□ -0.9
RPS6BP0CX38 TVP23YDR084C 600 nt9.45□□□□□ -0.9
RPS6BP0CX38 SPS100YHR139C 981 nt9.45□□□□□ -0.9
RPS6BP0CX38 YEL008WYEL008W 381 nt9.44□□□□□ -0.9
RPS6BP0CX38 LSM12YHR121W 564 nt9.44□□□□□ -0.9
RPS6BP0CX38 YPL168WYPL168W 1293 nt9.44□□□□□ -0.9
RPS6BP0CX38 THI72YOR192C 1800 nt9.43□□□□□ -0.9
RPS6BP0CX38 YHP1YDR451C 1062 nt9.43□□□□□ -0.9
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