Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRR35P0CG20 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRR35P0CG20 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRR35P0CG20 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRR35P0CG20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRR35P0CG20 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRR35P0CG20 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRR35P0CG20 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRR35P0CG20 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms