Protein–RNA interactions for Protein: P0C881

RSPH10B, Radial spoke head 10 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10BP0C881 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RSPH10BP0C881 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RSPH10BP0C881 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RSPH10BP0C881 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RSPH10BP0C881 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RSPH10BP0C881 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RSPH10BP0C881 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RSPH10BP0C881 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RSPH10BP0C881 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms