Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CT47B1P0C2W7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CT47B1P0C2W7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CT47B1P0C2W7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CT47B1P0C2W7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CT47B1P0C2W7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CT47B1P0C2W7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CT47B1P0C2W7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms