Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF4AO95239 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF4AO95239 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF4AO95239 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KIF4AO95239 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KIF4AO95239 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KIF4AO95239 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms