Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC31AO94979 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC31AO94979 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31AO94979 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31AO94979 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31AO94979 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEC31AO94979 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC31AO94979 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC31AO94979 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC31AO94979 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC31AO94979 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC31AO94979 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31AO94979 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31AO94979 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SEC31AO94979 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEC31AO94979 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SEC31AO94979 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC31AO94979 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC31AO94979 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms