Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP9O43818 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP9O43818 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP9O43818 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP9O43818 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP9O43818 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP9O43818 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP9O43818 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP9O43818 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP9O43818 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP9O43818 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP9O43818 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP9O43818 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP9O43818 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP9O43818 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP9O43818 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP9O43818 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP9O43818 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP9O43818 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP9O43818 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP9O43818 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP9O43818 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP9O43818 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP9O43818 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP9O43818 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP9O43818 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP9O43818 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP9O43818 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP9O43818 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP9O43818 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP9O43818 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP9O43818 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP9O43818 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP9O43818 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP9O43818 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP9O43818 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRP9O43818 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RRP9O43818 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP9O43818 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP9O43818 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP9O43818 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRP9O43818 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRP9O43818 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP9O43818 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP9O43818 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRP9O43818 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP9O43818 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP9O43818 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP9O43818 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRP9O43818 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP9O43818 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP9O43818 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRP9O43818 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRP9O43818 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRP9O43818 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRP9O43818 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRP9O43818 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP9O43818 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRP9O43818 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP9O43818 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP9O43818 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP9O43818 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRP9O43818 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP9O43818 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP9O43818 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP9O43818 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP9O43818 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP9O43818 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP9O43818 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP9O43818 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP9O43818 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP9O43818 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP9O43818 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP9O43818 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP9O43818 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP9O43818 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP9O43818 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP9O43818 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP9O43818 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRP9O43818 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP9O43818 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP9O43818 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP9O43818 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP9O43818 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP9O43818 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP9O43818 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP9O43818 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP9O43818 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP9O43818 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP9O43818 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP9O43818 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP9O43818 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP9O43818 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP9O43818 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP9O43818 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP9O43818 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP9O43818 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP9O43818 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP9O43818 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP9O43818 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms