Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHADO15335 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHADO15335 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHADO15335 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHADO15335 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHADO15335 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHADO15335 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHADO15335 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHADO15335 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHADO15335 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHADO15335 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHADO15335 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHADO15335 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHADO15335 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHADO15335 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHADO15335 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHADO15335 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHADO15335 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHADO15335 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHADO15335 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHADO15335 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CHADO15335 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHADO15335 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHADO15335 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHADO15335 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHADO15335 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHADO15335 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHADO15335 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHADO15335 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHADO15335 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHADO15335 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHADO15335 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHADO15335 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHADO15335 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHADO15335 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHADO15335 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHADO15335 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHADO15335 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CHADO15335 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHADO15335 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHADO15335 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHADO15335 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHADO15335 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHADO15335 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHADO15335 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHADO15335 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHADO15335 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHADO15335 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHADO15335 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHADO15335 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHADO15335 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHADO15335 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHADO15335 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHADO15335 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHADO15335 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHADO15335 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHADO15335 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHADO15335 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHADO15335 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CHADO15335 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHADO15335 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHADO15335 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHADO15335 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHADO15335 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHADO15335 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHADO15335 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CHADO15335 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHADO15335 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHADO15335 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHADO15335 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHADO15335 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHADO15335 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHADO15335 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHADO15335 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHADO15335 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHADO15335 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHADO15335 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHADO15335 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHADO15335 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHADO15335 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHADO15335 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHADO15335 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHADO15335 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHADO15335 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHADO15335 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHADO15335 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHADO15335 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHADO15335 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHADO15335 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHADO15335 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHADO15335 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHADO15335 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms