Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCYO14598 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCYO14598 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VCYO14598 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VCYO14598 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCYO14598 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VCYO14598 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCYO14598 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCYO14598 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VCYO14598 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCYO14598 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCYO14598 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VCYO14598 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VCYO14598 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VCYO14598 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VCYO14598 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VCYO14598 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VCYO14598 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VCYO14598 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VCYO14598 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VCYO14598 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VCYO14598 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VCYO14598 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VCYO14598 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VCYO14598 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VCYO14598 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VCYO14598 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VCYO14598 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VCYO14598 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VCYO14598 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VCYO14598 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VCYO14598 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VCYO14598 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCYO14598 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCYO14598 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCYO14598 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCYO14598 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCYO14598 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCYO14598 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCYO14598 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VCYO14598 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCYO14598 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCYO14598 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VCYO14598 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCYO14598 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCYO14598 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VCYO14598 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCYO14598 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCYO14598 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCYO14598 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCYO14598 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCYO14598 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCYO14598 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCYO14598 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCYO14598 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCYO14598 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCYO14598 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCYO14598 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCYO14598 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCYO14598 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VCYO14598 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCYO14598 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCYO14598 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCYO14598 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCYO14598 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCYO14598 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCYO14598 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCYO14598 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCYO14598 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VCYO14598 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCYO14598 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCYO14598 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCYO14598 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCYO14598 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCYO14598 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCYO14598 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCYO14598 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCYO14598 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCYO14598 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCYO14598 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCYO14598 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCYO14598 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VCYO14598 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCYO14598 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCYO14598 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VCYO14598 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCYO14598 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCYO14598 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VCYO14598 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCYO14598 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCYO14598 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCYO14598 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VCYO14598 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCYO14598 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCYO14598 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VCYO14598 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCYO14598 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCYO14598 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VCYO14598 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VCYO14598 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms