Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB19A4D1S5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB19A4D1S5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB19A4D1S5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB19A4D1S5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB19A4D1S5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB19A4D1S5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms