Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPD8

KDM4F, Lysine demethylase 4F, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4FA0A1W2PPD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
KDM4FA0A1W2PPD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
KDM4FA0A1W2PPD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
KDM4FA0A1W2PPD8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
KDM4FA0A1W2PPD8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
KDM4FA0A1W2PPD8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
KDM4FA0A1W2PPD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
KDM4FA0A1W2PPD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
KDM4FA0A1W2PPD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
KDM4FA0A1W2PPD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
KDM4FA0A1W2PPD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
KDM4FA0A1W2PPD8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
KDM4FA0A1W2PPD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
KDM4FA0A1W2PPD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
KDM4FA0A1W2PPD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
KDM4FA0A1W2PPD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
KDM4FA0A1W2PPD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
KDM4FA0A1W2PPD8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
KDM4FA0A1W2PPD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
KDM4FA0A1W2PPD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
KDM4FA0A1W2PPD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM4FA0A1W2PPD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
KDM4FA0A1W2PPD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
KDM4FA0A1W2PPD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
KDM4FA0A1W2PPD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM4FA0A1W2PPD8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM4FA0A1W2PPD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
KDM4FA0A1W2PPD8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
KDM4FA0A1W2PPD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
KDM4FA0A1W2PPD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KDM4FA0A1W2PPD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KDM4FA0A1W2PPD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
KDM4FA0A1W2PPD8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
KDM4FA0A1W2PPD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.25■■■■■ 4.03
KDM4FA0A1W2PPD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
KDM4FA0A1W2PPD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM4FA0A1W2PPD8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM4FA0A1W2PPD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
KDM4FA0A1W2PPD8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
KDM4FA0A1W2PPD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
KDM4FA0A1W2PPD8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
KDM4FA0A1W2PPD8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
KDM4FA0A1W2PPD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
KDM4FA0A1W2PPD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
KDM4FA0A1W2PPD8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
KDM4FA0A1W2PPD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
KDM4FA0A1W2PPD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
KDM4FA0A1W2PPD8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
KDM4FA0A1W2PPD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM4FA0A1W2PPD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
KDM4FA0A1W2PPD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
KDM4FA0A1W2PPD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms