Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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ARL2-SNX15V9GYD0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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