Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms