Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCDHB2Q9Y5E7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB2Q9Y5E7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms