Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KIF3AQ9Y496 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KIF3AQ9Y496 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms