Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3HCC1Q9Y3T6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms