Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BP1Q9Y3L3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms