Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9Y3F1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms