Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUDCQ9Y266 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUDCQ9Y266 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms