Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SHOC2Q9UQ13 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SHOC2Q9UQ13 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms