Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRAK1Q9UPV9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAK1Q9UPV9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAK1Q9UPV9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms