Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAMD4AQ9UPU9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms