Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SETD1BQ9UPS6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SETD1BQ9UPS6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms