Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms