Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRQQ9UMZ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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