Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNRGQ9UMZ2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNRGQ9UMZ2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms