Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP18Q9UMW8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP18Q9UMW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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