Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNRF3Q9ULT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNRF3Q9ULT6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms