Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPCN1Q9ULQ1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPCN1Q9ULQ1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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