Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN2Q9ULH4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN2Q9ULH4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms