Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF608Q9ULD9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF608Q9ULD9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZNF608Q9ULD9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms