Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AMFRQ9UKV5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AMFRQ9UKV5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms