Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms