Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GGA1Q9UJY5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms