Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPUSD1Q9UJJ7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms