Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PUF60Q9UHX1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PUF60Q9UHX1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms