Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NPC1L1Q9UHC9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NPC1L1Q9UHC9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms