Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCF2Q9UG63 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCF2Q9UG63 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms