Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB4Q9UDY4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms